Kompassquallen fühlen sich viele Meter unter der Wasseroberfläche wohl. Jüngere Quallen tauchen vermehrt im Mai auf. Die älteren Quallen findet man wiederum eher von Juli bis September. An der niederländischen Küste tauchen sie aber auch von August bis Oktober auf. Die Kompassqualle ist ein Zwitter. Anfangs entwickelt sie vorerst nur männliche Geschlechtsorgane. Später besitzt sie männliche als auch weibliche Geschlechtsorgane und im Anschluss nur noch die weiblichen. Während der mittleren Phase kann sich die Kompassqualle selbst befruchten. Ansonsten entwickeln sich im Muttertier die befruchteten Eier zu Planulalarven, welche ins freie Wasser entlassen werden. Sie lassen sich danach auf dem Meeresgrund nieder und entwickeln Scyphopolypen. Diese bilden wiederum Ephyralarven. Bis diese Larven sich zu geschlechtsreifen Quallen entwickeln, leben sie im Plankton.